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A dosagem da alfa-1 antitripsina nas fezes é empregada como indicador de perda de proteínas pelo trato digestivo, dada sua resistência à degradação pelas enzimas digestivas.

Evitar o uso de medicamentos laxativos, antiácidos e contraste oral nas 72 horas que antecedem a coleta, a menos que haja orientação médica

Geralmente é solicitado para avaliar se há a elevação dos níveis dessa proteína que pode ser observada em condições como enteropatias perdedoras de proteína, doença inflamatória intestinal, doença celíaca, intolerância ao leite de vaca, carcinoma gástrico, linfomas do trato digestivo, Doença de Whipple, gastroenteropatia alérgica, linfagectasia intestinal, hipogamaglobulinemia congênita e Síndrome de Menetrier